Liste des figures …………………………………………………………………………….………..I
Liste des tableaux ………………………………………………………………………..…………III
Liste des abréviations ..……………………………………………………………………..………IV
Sommaire
Introduction ................................................................................................................................. 9
Chapitre I : Généralités ............................................................................................................... 11
1. Présentation de la zone d’étude ............................................................................................ 12
2. Position systématique et présentation des familles et espèces étudiées ................................... 12
2.1. La famille des Scorpaenidae .......................................................................................... 13
2.1.1. Scorpaena maderensis Valenciennes 1833 .............................................................. 13
1.1.2. Scorpaena porcus Linnaeus 1758 ............................................................................ 14
1.1.3. Scorpaena scrofa Linnaeus 1758............................................................................. 14
1.1.4. Scorpaena notata Rafinesque 1810 ......................................................................... 14
1.1.5. Scorpaena elongata Cadenat 1943 .......................................................................... 15
2.2. La famille des Labridae ................................................................................................. 15
2.2.1. Le genre Labrus ..................................................................................................... 15
2.2.1.1. Labrus bergylta Ascanius 1767 ......................................................................... 15
2.2.1.2. Labrus merula Linnaeus 1758........................................................................... 16
2.2.1.3. Labrus viridis Linnaeus 1758............................................................................ 16
2.2.1.4. Labus mixtus Linnaeus 1758 ............................................................................. 16
2.2.2. Le genre Symphodus ............................................................................................... 17
2.2.2.1. Symphodus melops Linnaeus 1758 .................................................................... 17
2.2.2.2. Symphodus roissali (Risso 1810) ...................................................................... 17
Chapitre II : Matériel et méthodes ............................................................................................... 18
1. Echantillonnage .................................................................................................................. 19
2. Morphologie ....................................................................................................................... 20
3. Morphométrie ..................................................................................................................... 20
3.1. Caractères morphométriques ......................................................................................... 20
3.2. Analyse en composantes principales .............................................................................. 23
4. Génétique moléculaire......................................................................................................... 24
4.1. Le barcode moléculaire ................................................................................................. 24
4.2. Le marqueur génétique.................................................................................................. 25
4.3. Systématique phylogénétique ........................................................................................ 26
4.3.1. Les méthodes phylogénétiques ................................................................................ 27
4.3.2. Méthode de reconstruction d'arbres phylogénétiques ................................................ 27
4.3.3. Evaluation de la robustesse des arbres phylogénétiques : le test de bootstrap ............ 28
4.3.4. Enracinement de l’arbre phylogénétique .................................................................. 28
4.3.5. Principes des techniques de génétique moléculaire................................................... 28
Liste des tableaux ………………………………………………………………………..…………III
Liste des abréviations ..……………………………………………………………………..………IV
Sommaire
Introduction ................................................................................................................................. 9
Chapitre I : Généralités ............................................................................................................... 11
1. Présentation de la zone d’étude ............................................................................................ 12
2. Position systématique et présentation des familles et espèces étudiées ................................... 12
2.1. La famille des Scorpaenidae .......................................................................................... 13
2.1.1. Scorpaena maderensis Valenciennes 1833 .............................................................. 13
1.1.2. Scorpaena porcus Linnaeus 1758 ............................................................................ 14
1.1.3. Scorpaena scrofa Linnaeus 1758............................................................................. 14
1.1.4. Scorpaena notata Rafinesque 1810 ......................................................................... 14
1.1.5. Scorpaena elongata Cadenat 1943 .......................................................................... 15
2.2. La famille des Labridae ................................................................................................. 15
2.2.1. Le genre Labrus ..................................................................................................... 15
2.2.1.1. Labrus bergylta Ascanius 1767 ......................................................................... 15
2.2.1.2. Labrus merula Linnaeus 1758........................................................................... 16
2.2.1.3. Labrus viridis Linnaeus 1758............................................................................ 16
2.2.1.4. Labus mixtus Linnaeus 1758 ............................................................................. 16
2.2.2. Le genre Symphodus ............................................................................................... 17
2.2.2.1. Symphodus melops Linnaeus 1758 .................................................................... 17
2.2.2.2. Symphodus roissali (Risso 1810) ...................................................................... 17
Chapitre II : Matériel et méthodes ............................................................................................... 18
1. Echantillonnage .................................................................................................................. 19
2. Morphologie ....................................................................................................................... 20
3. Morphométrie ..................................................................................................................... 20
3.1. Caractères morphométriques ......................................................................................... 20
3.2. Analyse en composantes principales .............................................................................. 23
4. Génétique moléculaire......................................................................................................... 24
4.1. Le barcode moléculaire ................................................................................................. 24
4.2. Le marqueur génétique.................................................................................................. 25
4.3. Systématique phylogénétique ........................................................................................ 26
4.3.1. Les méthodes phylogénétiques ................................................................................ 27
4.3.2. Méthode de reconstruction d'arbres phylogénétiques ................................................ 27
4.3.3. Evaluation de la robustesse des arbres phylogénétiques : le test de bootstrap ............ 28
4.3.4. Enracinement de l’arbre phylogénétique .................................................................. 28
4.3.5. Principes des techniques de génétique moléculaire................................................... 28