13.6 Retour sur les ordinateurs ` a ADN
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T C G T ... G G C T
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A G T T A G C A ... C C G A G C A A
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Mais comment utiliser la polym´ erase pour multiplier les chaˆ ınes qui nous int´ eressent ?
La premi` ere ´ etape est de s´ eparer tous les brins doubles pour en faire des brins simples.
Pour ce faire, on chauffe les chaˆ ınes d’ADN en solution jusqu’` a ce que tous les brins
soient s´ epar´ es. Le brin double se s´ epare donc en deux brins simples : un « brin arˆ ete »
et un « brin sommet ». Par exemple, nous passons du brin double
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T C G T ... G G C T
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A G T T A G C A ... C C G A G C A A
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au brin arˆ ete
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T C G T ... G G C T
et au brin sommet
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A G T T A G C A ... C C G A G C A A.
Explication de la notation 5’–3’ Regardons un brin simple d’ADN. Son ossature
ext´ erieure est form´ ee de sucres. Chaque base azot´ ee est li´ ee ` a un sucre. Chacun des
sucres comporte cinq atomes de carbone (num´ erot´ es de 1’ ` a 5’). La base est li´ ee au
carbone 1’, tandis qu’un groupe hydroxyle (OH) est attach´ e au 3’ et un phosphate au
5’, du cˆ ot´ e oppos´ e ` a l’hydroxyle. Quand deux sucres correspondant `
a deux bases voisines
sur le brin se lient, un groupe hydroxyle s’attache toujours `
a un groupe phosphate.
Donc, si on imagine une chaˆ ıne d’ADN dont la premi` ere base est li´ ee ` a un sucre qui a
un groupe phosphate libre (elle sera appel´ ee 5’), l’hydroxyle du cˆ ot´ e oppos´ e sera attach´ e
au groupe phosphate du sucre de la base suivante, dont le groupe hydroxyle sera ` a son
tour li´ e au groupe phosphate du sucre de la troisi` eme base, etc. Le sucre de la derni` ere
base de cette chaˆ ıne aura donc un groupe hydroxyle libre, et cette base sera appel´ ee 3’.
Ce sera donc une chaˆ ıne allant de 5’ vers 3’.
Lors de la formation d’un double brin d’ADN, une chaˆ ıne 5’–3’ ne peut se lier qu’` a
une chaˆ ıne 3’–5’. Les rang´ ees de sucres sont ` a l’ext´ erieur de la double h´ elice et en forment
l’ossature. Les bases s’attachent ensemble deux `
a deux par des liens hydrog` enes.
La r´ eplication dans notre exemple On introduit dans l’´ eprouvette une grande
quantit´ e d’amorces de deux types diff´ erents. Le premier est constitu´ e du nom du sommet
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Mais comment utiliser la polym´ erase pour multiplier les chaˆ ınes qui nous int´ eressent ?
La premi` ere ´ etape est de s´ eparer tous les brins doubles pour en faire des brins simples.
Pour ce faire, on chauffe les chaˆ ınes d’ADN en solution jusqu’` a ce que tous les brins
soient s´ epar´ es. Le brin double se s´ epare donc en deux brins simples : un « brin arˆ ete »
et un « brin sommet ». Par exemple, nous passons du brin double
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et au brin sommet
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Explication de la notation 5’–3’ Regardons un brin simple d’ADN. Son ossature
ext´ erieure est form´ ee de sucres. Chaque base azot´ ee est li´ ee ` a un sucre. Chacun des
sucres comporte cinq atomes de carbone (num´ erot´ es de 1’ ` a 5’). La base est li´ ee au
carbone 1’, tandis qu’un groupe hydroxyle (OH) est attach´ e au 3’ et un phosphate au
5’, du cˆ ot´ e oppos´ e ` a l’hydroxyle. Quand deux sucres correspondant `
a deux bases voisines
sur le brin se lient, un groupe hydroxyle s’attache toujours `
a un groupe phosphate.
Donc, si on imagine une chaˆ ıne d’ADN dont la premi` ere base est li´ ee ` a un sucre qui a
un groupe phosphate libre (elle sera appel´ ee 5’), l’hydroxyle du cˆ ot´ e oppos´ e sera attach´ e
au groupe phosphate du sucre de la base suivante, dont le groupe hydroxyle sera ` a son
tour li´ e au groupe phosphate du sucre de la troisi` eme base, etc. Le sucre de la derni` ere
base de cette chaˆ ıne aura donc un groupe hydroxyle libre, et cette base sera appel´ ee 3’.
Ce sera donc une chaˆ ıne allant de 5’ vers 3’.
Lors de la formation d’un double brin d’ADN, une chaˆ ıne 5’–3’ ne peut se lier qu’` a
une chaˆ ıne 3’–5’. Les rang´ ees de sucres sont ` a l’ext´ erieur de la double h´ elice et en forment
l’ossature. Les bases s’attachent ensemble deux `
a deux par des liens hydrog` enes.
La r´ eplication dans notre exemple On introduit dans l’´ eprouvette une grande
quantit´ e d’amorces de deux types diff´ erents. Le premier est constitu´ e du nom du sommet