Les logiciels de biostatistiques
Nous donnons, à titre indicatif, une liste de logiciels statistiques
couramment utilisés. Dans tous ces logiciels, les avantages et les inconvénients sont très subjectifs. Dans un traitement statistique, la phase
qui prend généralement le plus de temps est celle de la saisie et du
nettoyage des données, bien plus que celle de l’analyse proprement
dite. Nous attirons donc l’attention sur la nécessité d’une conception
ergonomique du cahier d’observation, afin de faciliter ces étapes.
Selon le volume d’information à saisir, l’organisation de la saisie ellemême, un tableur (par exemple Open Office Calc, Microsoft EXCEL™)
pourra être suffisant ; l’utilisation de bases de données s’avérera nécessaire en cas de gros volumes et de questionnaires dépendants (Open
Office BASE, Microsoft ACCESS
TM ou SQL Server
TM
, MySQL
TM
Ö). De
plus en plus, les logiciels de statistiques permettent également de créer
des outils de saisie. On attirera également l’attention sur la disponibilité de solution de saisie à distance par exemple avec LIMESurvey qui
permet la saisie par Internet. Finalement, toute base de données doit
être déclarée à la CNIL et recevoir une autorisation.
Ci-après, une liste non exhaustive des logiciels utilisables est donnée
par ordre alphabétique. À noter que d’autres logiciels, non spécifiques,
offrent des capacités statistiques : certains tableurs ainsi que certains
logiciels tournés vers la réalisation de graphiques. Pour des analyses
simples, le choix du logiciel n’est pas essentiel, tous les logiciels proposant au minimum les tests usuels. Le choix devra être fait avant tout
en fonction des ressources disponibles, de l’appétence envers l’univers
informatique, et des possibilités locales de soutien !
Biostatgv : Le site internet Biostatgv (http://www.u707.jussieu.fr/
biostatgv) permet de réaliser la plupart des tests classiques. Les calculs
sont faits dans le logiciel R (voir ci-après). Il s’agit donc d’une solution
simple pour effectuer des analyses descriptives, ainsi que des tests de
différence, d’association. Il est également possible de calculer la taille
des essais ou nombre de sujets.
R : Le logiciel R est un logiciel libre, gratuit, disponible sur le site
CRAN (http://cran.r-project.org). Ce logiciel est très utilisé dans le
milieu académique. Il peut être enrichi facilement par un système de
Nous donnons, à titre indicatif, une liste de logiciels statistiques
couramment utilisés. Dans tous ces logiciels, les avantages et les inconvénients sont très subjectifs. Dans un traitement statistique, la phase
qui prend généralement le plus de temps est celle de la saisie et du
nettoyage des données, bien plus que celle de l’analyse proprement
dite. Nous attirons donc l’attention sur la nécessité d’une conception
ergonomique du cahier d’observation, afin de faciliter ces étapes.
Selon le volume d’information à saisir, l’organisation de la saisie ellemême, un tableur (par exemple Open Office Calc, Microsoft EXCEL™)
pourra être suffisant ; l’utilisation de bases de données s’avérera nécessaire en cas de gros volumes et de questionnaires dépendants (Open
Office BASE, Microsoft ACCESS
TM ou SQL Server
TM
, MySQL
TM
Ö). De
plus en plus, les logiciels de statistiques permettent également de créer
des outils de saisie. On attirera également l’attention sur la disponibilité de solution de saisie à distance par exemple avec LIMESurvey qui
permet la saisie par Internet. Finalement, toute base de données doit
être déclarée à la CNIL et recevoir une autorisation.
Ci-après, une liste non exhaustive des logiciels utilisables est donnée
par ordre alphabétique. À noter que d’autres logiciels, non spécifiques,
offrent des capacités statistiques : certains tableurs ainsi que certains
logiciels tournés vers la réalisation de graphiques. Pour des analyses
simples, le choix du logiciel n’est pas essentiel, tous les logiciels proposant au minimum les tests usuels. Le choix devra être fait avant tout
en fonction des ressources disponibles, de l’appétence envers l’univers
informatique, et des possibilités locales de soutien !
Biostatgv : Le site internet Biostatgv (http://www.u707.jussieu.fr/
biostatgv) permet de réaliser la plupart des tests classiques. Les calculs
sont faits dans le logiciel R (voir ci-après). Il s’agit donc d’une solution
simple pour effectuer des analyses descriptives, ainsi que des tests de
différence, d’association. Il est également possible de calculer la taille
des essais ou nombre de sujets.
R : Le logiciel R est un logiciel libre, gratuit, disponible sur le site
CRAN (http://cran.r-project.org). Ce logiciel est très utilisé dans le
milieu académique. Il peut être enrichi facilement par un système de