Chapitre II : Modélisation du risque d’introduction des espèces non-indigènes par le
biofouling des coques des navires: Cas d’étude du port d’Arzew
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perpendiculaire, le tirant d’eau d’été, la vitesse maximale et typique de chaque navire, la
largeur et la longueur du navire, la distance parcourue entre deux ports d’escale, l’heure et
la date d’entrée et de sortie de chaque port ; transmis par l’AIS terrestre. Cette dernière
information nous a permis d’estimer la vitesse moyenne de chaque voyage. Les données
ont été téléchargées individuellement pour chaque navire (recherche par numéro IMO),
sous format CSV, puis extraite au fichier de base contenant les 738 voyages ; soit plus de
10000 mouvements de navires transités par le port d’Arzew durant l’année 2015-2016.
Données environnementales :
Les couches environnementales ont été consultées à partir de Bio-ORACLE
(https://www.bio-oracle.org/downloads-to-email.php),
comme
indiqué
dans
(TYBERGHEIN et al., 2012) et (ASSIS et al., 2018). Le paquet de données :
All.Present.Surface.BOv2_1.asc (70 N – 70 S Real Values) a été utilisé, qui comprenait 65
couches raster géoréférenciés au WSG 84 avec une résolution de 5 min d’arc. Ces couches
contiennent 65 paramètres environnementaux de la surface de la mer pour l’ensemble du
globe (de 0m-20m), comme la température, la salinité, l’oxygène dissous, la
chlorophylle…etc.
L’extraction de ses données pour chacun des ports donneurs s’est effectué avec le logiciel
QGIS 2.18 en utilisant l’extension “Point Sampling Tool”. Le fichier CSV comprenant les
coordonnées géographiques des 126 ports de provenance a été converti au degrés décimaux
WGS 84 en utilisant le logiciel GRASS GIS 7.0.5 avant d’être incorporé dans QGIS avec
les 65 couches environnementales. L’extension “Point Sampling Tool” (outil
d’échantillonnage ponctuel) permet d’extraire les valeurs numériques de chacun des
images rasters pour chaque combinaison longitude/latitude du fichier CSV contenant les
emplacements des ports de provenance.
Pour la simulation du scénario de changement climatique, le package
“All.2050AOGCM.RCP26.Benthic.Mean.Depth.BOv2_1.asc” contenant des prévisions à
l’horizon 2050 a été utilisé.
Données biogéographiques :
Les écorégions sont des régions géographiques de l'océan qui partagent des ensembles
d'espèces en raison d'une histoire évolutive commune. Nous avons obtenu les données sur
les écorégions de “Marine Ecoregion of the World (MEOW)” (SPALDING et al., 2007)
pour exprimer la probabilité d’invasion (Pij(Inv)) par écorégions de provenance. La couche
biofouling des coques des navires: Cas d’étude du port d’Arzew
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perpendiculaire, le tirant d’eau d’été, la vitesse maximale et typique de chaque navire, la
largeur et la longueur du navire, la distance parcourue entre deux ports d’escale, l’heure et
la date d’entrée et de sortie de chaque port ; transmis par l’AIS terrestre. Cette dernière
information nous a permis d’estimer la vitesse moyenne de chaque voyage. Les données
ont été téléchargées individuellement pour chaque navire (recherche par numéro IMO),
sous format CSV, puis extraite au fichier de base contenant les 738 voyages ; soit plus de
10000 mouvements de navires transités par le port d’Arzew durant l’année 2015-2016.
Données environnementales :
Les couches environnementales ont été consultées à partir de Bio-ORACLE
(https://www.bio-oracle.org/downloads-to-email.php),
comme
indiqué
dans
(TYBERGHEIN et al., 2012) et (ASSIS et al., 2018). Le paquet de données :
All.Present.Surface.BOv2_1.asc (70 N – 70 S Real Values) a été utilisé, qui comprenait 65
couches raster géoréférenciés au WSG 84 avec une résolution de 5 min d’arc. Ces couches
contiennent 65 paramètres environnementaux de la surface de la mer pour l’ensemble du
globe (de 0m-20m), comme la température, la salinité, l’oxygène dissous, la
chlorophylle…etc.
L’extraction de ses données pour chacun des ports donneurs s’est effectué avec le logiciel
QGIS 2.18 en utilisant l’extension “Point Sampling Tool”. Le fichier CSV comprenant les
coordonnées géographiques des 126 ports de provenance a été converti au degrés décimaux
WGS 84 en utilisant le logiciel GRASS GIS 7.0.5 avant d’être incorporé dans QGIS avec
les 65 couches environnementales. L’extension “Point Sampling Tool” (outil
d’échantillonnage ponctuel) permet d’extraire les valeurs numériques de chacun des
images rasters pour chaque combinaison longitude/latitude du fichier CSV contenant les
emplacements des ports de provenance.
Pour la simulation du scénario de changement climatique, le package
“All.2050AOGCM.RCP26.Benthic.Mean.Depth.BOv2_1.asc” contenant des prévisions à
l’horizon 2050 a été utilisé.
Données biogéographiques :
Les écorégions sont des régions géographiques de l'océan qui partagent des ensembles
d'espèces en raison d'une histoire évolutive commune. Nous avons obtenu les données sur
les écorégions de “Marine Ecoregion of the World (MEOW)” (SPALDING et al., 2007)
pour exprimer la probabilité d’invasion (Pij(Inv)) par écorégions de provenance. La couche