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© Springer Nature Switzerland AG 2021
M. J. Pastorino, P. Marchelli (eds.), Low Intensity Breeding of Native Forest
Trees in Argentina, https://doi.org/10.1007/978-3-030-56462-9_17
Chapter 17
Application of High-Throughput
Sequencing Technologies in Native Forest
Tree Species in Argentina: Implications
for Breeding
Susana L. Torales, Verónica El Mujtar, Susana Marcucci-Poltri,
Florencia Pomponio, Carolina Soliani, Pamela Villalba,
Maximiliano Estravis-Barcala, Lorena Klein, Martín García,
Vivien Pentreath, María Virginia Inza, Natalia C. Aguirre, Máximo Rivarola,
Cintia Acuña, Sergio González, Sabrina Amalfi, Micaela López,
Pauline Garnier-Géré, Nicolás Bellora, and Verónica Arana
The high-throughput sequencing (HTS) or next-generation sequencing (NGS) technologies and associated bioinformatics tools have become a powerful approach for
the development of entire genomes and transcriptomes, as well as molecular markers, on model and non-model organisms (Badenes et  al. 2016). For non-model
perennial trees, the HTS technologies provide a rapid way to access to genomic
S. L. Torales (*) · F. Pomponio · M. V. Inza · M. López
Instituto de Recursos Biológicos (IRB), Centro de Investigaciones de Recursos
Naturales (CIRN), INTA. Hurlingham, Buenos Aires, Argentina
e-mail: torales.susana@inta.gob.ar
V. El Mujtar · C. Soliani · V. Arana
Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche (IFAB) INTA-CONICET,
Bariloche, Argentina
S. Marcucci-Poltri · P. Villalba · M. García · N. C. Aguirre · M. Rivarola · C. Acuña
S. González · S. Amalfi
Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (IABiMO) INTA-CONICET,
Buenos Aires, Argentina
M. Estravis-Barcala · N. Bellora
Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales (IPATEC)
CONICET–UNCo, San Carlos de Bariloche, Argentina
L. Klein
INTA EEA Saénz Peña, Saénz Peña, Argentina
V. Pentreath
Universidad Nacional de la Patagonia San Juan Bosco, Comodoro Rivadavia, Argentina
P. Garnier-Géré
INRAE, Paris, France