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Microbiologie pratique pour le laboratoire d’analyses ou de contrôle sanitaire
Les autres espèces de staphylocoques retrouvées chez l’homme sont à coagulase négative (SCN) sauf Staphylococcus schleiferi subsp. coagulons (cf. infra,
paragraphe 6.1.1.): S. auricularis, S. capitis, S. caprae (initialement isolée du
lait de chèvre), S. cohnii, S. epidermidis, S. haemolyticus, S. hominis,
S. lugdunensis, S. pasteuri, S. saccharolyticus, S. saprophyticus, S. simulons,
S. warneri et S. xylosus (Chaverot et al., 2005).
Staphylococcus pasteuri (phénotypiquement proche de S. warneri, ) a été isolée chez l'homme, l’animal et à partir d’aliments (Chesneau et al., 1993).
Les espèces de SCN sont des bactéries pathogènes opportunistes pour l’homme,
fréquemment isolées en milieu hospitalier. Elles peuvent être responsables :
-d'infections nosocomiales ou acquises hors de l’hôpital à S. epidermidis... ;
- d'endocardites à SCN autres que S. epidermidis ;
- de cystites aiguës à S. saprophyticus chez la femme jeune en bonne santé ;
- d'infections urinaires à S. haemolyticus, S. warneri, S. hominis, S. cohnii et
S. saprophyticus ;
- ... (Ciupek et al., 2002).
Pour le pouvoir pathogène des SCN, cf. également Chaverot et al., 2005.
3.2.
Espèces de microcoques et ex-microcoques
L’évolution de la classification des principales espèces est exposée dans le
tableau 117 pour la période 1975-2005, compte tenu du fait que la nomenclature
de la deuxième colonne du tableau est toujours utilisée en pratique courante au
laboratoire. La couleur du pigment majeur produit par ces germes est donnée
dans la troisième colonne de ce tableau, mais elle peut présenter des nuances suivant l'origine des souches.
Les espèces Micrococcus agilis (à pigment rouge) et Micrococcus halobius
(sans pigment) de Kocur et al. (1975) ont été respectivement reclassées et renommées Arthrobacter agilis et Nesterenkonia halobius. Une nouvelle espèce Micrococcus antarticus a été isolée en Antarctique en 2000 (Liu et al., 2000) (cf. annexe
générale 3 « Classification phylogénique des bactéries », tableau 141).
Tableau 117 ■ Classification des principales espèces de microcoques et ex-microcoques.
M icrococcaceae
Genre Micrococcus
Kocur et al., 1975
Ex-M icrococcaceae'
Genres Micrococcus
et ex-Micrococcus1
Classification phylogénique
(couleur du pigment majeur)
Micrococcus luteus
Micrococcus luteus
Micrococcus luteus'
(jaune)
Micrococcus lylae
Micrococcus lylae
Micrococcus lylae'
(aucun pigment)
Micrococcus varions
te
V
Kocuria varions
Kocuria varions'
(jaune)
Micrococcus rose us
Kocuria rosea
Kocuria rosea'
(rose)
Microbiologie pratique pour le laboratoire d’analyses ou de contrôle sanitaire
Les autres espèces de staphylocoques retrouvées chez l’homme sont à coagulase négative (SCN) sauf Staphylococcus schleiferi subsp. coagulons (cf. infra,
paragraphe 6.1.1.): S. auricularis, S. capitis, S. caprae (initialement isolée du
lait de chèvre), S. cohnii, S. epidermidis, S. haemolyticus, S. hominis,
S. lugdunensis, S. pasteuri, S. saccharolyticus, S. saprophyticus, S. simulons,
S. warneri et S. xylosus (Chaverot et al., 2005).
Staphylococcus pasteuri (phénotypiquement proche de S. warneri, ) a été isolée chez l'homme, l’animal et à partir d’aliments (Chesneau et al., 1993).
Les espèces de SCN sont des bactéries pathogènes opportunistes pour l’homme,
fréquemment isolées en milieu hospitalier. Elles peuvent être responsables :
-d'infections nosocomiales ou acquises hors de l’hôpital à S. epidermidis... ;
- d'endocardites à SCN autres que S. epidermidis ;
- de cystites aiguës à S. saprophyticus chez la femme jeune en bonne santé ;
- d'infections urinaires à S. haemolyticus, S. warneri, S. hominis, S. cohnii et
S. saprophyticus ;
- ... (Ciupek et al., 2002).
Pour le pouvoir pathogène des SCN, cf. également Chaverot et al., 2005.
3.2.
Espèces de microcoques et ex-microcoques
L’évolution de la classification des principales espèces est exposée dans le
tableau 117 pour la période 1975-2005, compte tenu du fait que la nomenclature
de la deuxième colonne du tableau est toujours utilisée en pratique courante au
laboratoire. La couleur du pigment majeur produit par ces germes est donnée
dans la troisième colonne de ce tableau, mais elle peut présenter des nuances suivant l'origine des souches.
Les espèces Micrococcus agilis (à pigment rouge) et Micrococcus halobius
(sans pigment) de Kocur et al. (1975) ont été respectivement reclassées et renommées Arthrobacter agilis et Nesterenkonia halobius. Une nouvelle espèce Micrococcus antarticus a été isolée en Antarctique en 2000 (Liu et al., 2000) (cf. annexe
générale 3 « Classification phylogénique des bactéries », tableau 141).
Tableau 117 ■ Classification des principales espèces de microcoques et ex-microcoques.
M icrococcaceae
Genre Micrococcus
Kocur et al., 1975
Ex-M icrococcaceae'
Genres Micrococcus
et ex-Micrococcus1
Classification phylogénique
(couleur du pigment majeur)
Micrococcus luteus
Micrococcus luteus
Micrococcus luteus'
(jaune)
Micrococcus lylae
Micrococcus lylae
Micrococcus lylae'
(aucun pigment)
Micrococcus varions
te
V
Kocuria varions
Kocuria varions'
(jaune)
Micrococcus rose us
Kocuria rosea
Kocuria rosea'
(rose)