248
Microbiologie pratique pour le laboratoire d’analyses ou de contrôle sanitaire
2.
Entérobactéries courantes et rares
2.1.
Entérobactéries courantes
Les entérobactéries fréquemment rencontrées en bactériologie clinique,
alimentaire, des eaux... sont succinctement présentées en considérant leur
habitat naturel ou leur habitat lié aux activités anthropiques, leurs caractères
particuliers, leur pouvoir pathogène ou leur intérêt. Pour les salmonelles, leur
nomenclature est tout d’abord précisée. Les termes scientifiques intervenam
dans cette présentation sont définis dans l’annexe générale 1 « Lexique de
microbiologie ». Le nombre d’espèces de chaque genre est donné d’après le
Bergey’s Manual (2004).
2.1.1. Genre Escherichia (six espèces)
Escherichia coli ou « colibacille » est l’hôte normal de l’intestin de l’homme
et des animaux à sang chaud ; c’est un coliforme fécal, germe indicateur de
contamination fécale dans les eaux et les aliments (cf. infra, paragraphe 3.3.).
Les souches d’Escherichia coli responsables d’infections chez l’homme sont
différentes de celles qui constituent l’espèce dominante de la flore intestinale
aérobie des adultes et des enfants (Mihaila Amrouche et al., 2003).
Différents groupes ou classes d'Escherichia coli, sont impliqués dans des syndromes diarrhéiques chez l'homme et les jeunes enfants dans les pays en voie de
développement (PVD) ou les pays développés selon les cas :
- Escherichia coli entérohémorragiques (ETEC ou ECET), agent de la diarrhée du voyageur et de diarrhées infantiles, l’infection faisant suite à la consommation d'eau ou d'un aliment contaminé ;
- Escherichia coli entéropathogène (EPEC ou ECEP), agents de gastro-entérites infantiles... ;
- Escherichia coli entérohémorragique (EHEC), agents de colites hémorragiques...
Les sérotypes E. coli 0157 et E. coli 0157: H7 sont des EHEC, agents
d intoxications alimentaires graves liées à la consommation de viande, de jus de
pommes non pasteurisés... ; elles sont apparues en 1982 aux États-Unis et en
1^83 au ( anada. Le second sérotype est également dénommé Escherichia coli
vérotoxinogène (VTEC) (cf. infra, paragraphe 8.1.2.).
2.1.2. Genre Salmonella
2.12.1. Nomenclatures des salmonelles
La classification et la nomenclature des salmonelles est très évolutive et
complexe. La nomenclature actuelle et la nomenclature précédente des sal
?/2?
Microbiologie pratique pour le laboratoire d’analyses ou de contrôle sanitaire
2.
Entérobactéries courantes et rares
2.1.
Entérobactéries courantes
Les entérobactéries fréquemment rencontrées en bactériologie clinique,
alimentaire, des eaux... sont succinctement présentées en considérant leur
habitat naturel ou leur habitat lié aux activités anthropiques, leurs caractères
particuliers, leur pouvoir pathogène ou leur intérêt. Pour les salmonelles, leur
nomenclature est tout d’abord précisée. Les termes scientifiques intervenam
dans cette présentation sont définis dans l’annexe générale 1 « Lexique de
microbiologie ». Le nombre d’espèces de chaque genre est donné d’après le
Bergey’s Manual (2004).
2.1.1. Genre Escherichia (six espèces)
Escherichia coli ou « colibacille » est l’hôte normal de l’intestin de l’homme
et des animaux à sang chaud ; c’est un coliforme fécal, germe indicateur de
contamination fécale dans les eaux et les aliments (cf. infra, paragraphe 3.3.).
Les souches d’Escherichia coli responsables d’infections chez l’homme sont
différentes de celles qui constituent l’espèce dominante de la flore intestinale
aérobie des adultes et des enfants (Mihaila Amrouche et al., 2003).
Différents groupes ou classes d'Escherichia coli, sont impliqués dans des syndromes diarrhéiques chez l'homme et les jeunes enfants dans les pays en voie de
développement (PVD) ou les pays développés selon les cas :
- Escherichia coli entérohémorragiques (ETEC ou ECET), agent de la diarrhée du voyageur et de diarrhées infantiles, l’infection faisant suite à la consommation d'eau ou d'un aliment contaminé ;
- Escherichia coli entéropathogène (EPEC ou ECEP), agents de gastro-entérites infantiles... ;
- Escherichia coli entérohémorragique (EHEC), agents de colites hémorragiques...
Les sérotypes E. coli 0157 et E. coli 0157: H7 sont des EHEC, agents
d intoxications alimentaires graves liées à la consommation de viande, de jus de
pommes non pasteurisés... ; elles sont apparues en 1982 aux États-Unis et en
1^83 au ( anada. Le second sérotype est également dénommé Escherichia coli
vérotoxinogène (VTEC) (cf. infra, paragraphe 8.1.2.).
2.1.2. Genre Salmonella
2.12.1. Nomenclatures des salmonelles
La classification et la nomenclature des salmonelles est très évolutive et
complexe. La nomenclature actuelle et la nomenclature précédente des sal
?/2?