variance interclasse maximale et une variance intraclasse minimale (Delabre et col., 1973).
Temps de
prélèvement
Nombre total
de souches isolées
Nombres de souches issues des différents échantillons
EAU
Bacs 1 et 2
EAU
Bac 3
EAU
Bacs 4 et 5
EAU
Remplissage
MOULE
Tractus digestif
CREVETTE
Temps 0
40
-
-
-
40
-
-
4 e jour
60
40
-
20
-
-
-
5 e jour
40
-
•20
20
-
-
-
6 e jour
20
-
-
20
-
-
-
7 e jour
80
40
20
20
-
-
-
15 e jour
40
-
-
-
-
40
-
19 e jour
57
27
-
30
-
-
-
6 e mois
40
-
-
-
-
-
40
7 e mois
40
20
20
-
-
-
-
TOTAL
417
127
60
110
40
40
40
Tableau 1 : Origine et nombres de souches isolées et étudiées pour l’analyse numérique. Les bacs 1 et 2
contenaient une charge initiale de 90g de crevettes/m 2 ; le bac 3 une charge de 120 g/m 2 ; les bacs 4 et 5 une
charge de 150 g/m 2 .
L’exploitation du dendrogramme nécessite la définition d’un niveau de coupure matérialisant la distance taxonomique en dessous de laquelle les classes d’individus formées ou
taxons, sont assimilables à des écotypes du niveau générique ou spécifique dans le
meilleur des cas. La méthode employée pour définir ce niveau de coupure est directement
dérivée de la méthode proposée par Bianchi (1971) qui considère la courbe d’entrée des
souches dans le dendrogramme en fonction de la distance taxonomique. Pour les collections de souches comportant plusieurs centaines d’individus, cette méthode est difficilement utilisable du fait des faibles valeurs de distances taxonomiques calculées par le
Khi2. Par contre, la définition du niveau de coupure comme étant celui à partir duquel le
nombre de nœuds formés devient supérieur au nombre d’individus intégrés fournit les
mêmes résultats sans qu’il soit nécessaire de construire la courbe (Sohier, 1983).
La partition de la collection en taxons est une première étape de l’exploitation du
dendrogramme, chaque taxon est ensuite caractérisé par des indices synthétiques matérialisant les caractéristiques de la souche type (Bianchi, 1971).
- EAI : indice moyen de production d’exoenzymes.
- UAI : indice de versatilité nutritionnelle.
- UA-AA: indice moyen, d’utilisation des acides aminés. - UA-S, UA-OL, UA-AO,
UA-AG: idem respectivement pour les sucres, les alcools, les acides organiques et les
acides gras.
D’autres indices enfin sont simplement définis comme un pourcentage de souches possédant le caractère considéré parmi les souches composant le taxon.
RÉSULTATS
Étude quantitative
Les comptages indirects sont effectués pour trois bacs de charge animale initiale différente. Ils laissent apparaître une évolution similaire du nombre de bactéries hétérotrophes
285
Temps de
prélèvement
Nombre total
de souches isolées
Nombres de souches issues des différents échantillons
EAU
Bacs 1 et 2
EAU
Bac 3
EAU
Bacs 4 et 5
EAU
Remplissage
MOULE
Tractus digestif
CREVETTE
Temps 0
40
-
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-
40
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4 e jour
60
40
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20
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5 e jour
40
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•20
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6 e jour
20
-
-
20
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7 e jour
80
40
20
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15 e jour
40
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-
-
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40
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19 e jour
57
27
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30
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-
-
6 e mois
40
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40
7 e mois
40
20
20
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TOTAL
417
127
60
110
40
40
40
Tableau 1 : Origine et nombres de souches isolées et étudiées pour l’analyse numérique. Les bacs 1 et 2
contenaient une charge initiale de 90g de crevettes/m 2 ; le bac 3 une charge de 120 g/m 2 ; les bacs 4 et 5 une
charge de 150 g/m 2 .
L’exploitation du dendrogramme nécessite la définition d’un niveau de coupure matérialisant la distance taxonomique en dessous de laquelle les classes d’individus formées ou
taxons, sont assimilables à des écotypes du niveau générique ou spécifique dans le
meilleur des cas. La méthode employée pour définir ce niveau de coupure est directement
dérivée de la méthode proposée par Bianchi (1971) qui considère la courbe d’entrée des
souches dans le dendrogramme en fonction de la distance taxonomique. Pour les collections de souches comportant plusieurs centaines d’individus, cette méthode est difficilement utilisable du fait des faibles valeurs de distances taxonomiques calculées par le
Khi2. Par contre, la définition du niveau de coupure comme étant celui à partir duquel le
nombre de nœuds formés devient supérieur au nombre d’individus intégrés fournit les
mêmes résultats sans qu’il soit nécessaire de construire la courbe (Sohier, 1983).
La partition de la collection en taxons est une première étape de l’exploitation du
dendrogramme, chaque taxon est ensuite caractérisé par des indices synthétiques matérialisant les caractéristiques de la souche type (Bianchi, 1971).
- EAI : indice moyen de production d’exoenzymes.
- UAI : indice de versatilité nutritionnelle.
- UA-AA: indice moyen, d’utilisation des acides aminés. - UA-S, UA-OL, UA-AO,
UA-AG: idem respectivement pour les sucres, les alcools, les acides organiques et les
acides gras.
D’autres indices enfin sont simplement définis comme un pourcentage de souches possédant le caractère considéré parmi les souches composant le taxon.
RÉSULTATS
Étude quantitative
Les comptages indirects sont effectués pour trois bacs de charge animale initiale différente. Ils laissent apparaître une évolution similaire du nombre de bactéries hétérotrophes
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