SOMMAIRE
II.5.4.2. Classe B ........................................................................................................................ 16
II.5.4.3. Classe C ........................................................................................................................ 17
II.5.4.4. Classe D ........................................................................................................................ 17
III. Résistance aux antibiotiques dans l’environnement ............................................................. 18
MATERIEL ET METHODES ....................................................................................... 22
I. Présentation de la zone d’étude ........................................................................................ 22
II. Echantillonnage ................................................................................................................ 23
III. Matériel ................................................................................................................................ 23
III.1. Les antibiotiques en poudre ............................................................................................... 23
III.2. Les antibiotiques en disque ............................................................................................... 24
IV. Méthodes .............................................................................................................................. 25
IV.1. Analyse des paramètres physico-chimiques ..................................................................... 25
IV.1.1. Salinité ........................................................................................................................... 25
IV.1.2. Oxygène dissous ............................................................................................................ 25
IV.1.3. Potentiel hydrogène ........................................................................................................ 25
IV.1.4. La température ............................................................................................................... 25
IV.1.5. Demande biologique en oxygène (DBO 5 ) ..................................................................... 25
IV.1.6. Matières en suspension (MES) ................................................................................................. 26
IV.2. Analyse microbiologique par filtration sur membrane ..................................................... 26
IV.3. Prévalence de la résistance aux antibiotiques ................................................................... 26
IV.4. Isolement et identification bactérienne ............................................................................. 27
IV.5. Etude de la sensibilité aux antibiotiques par antibiogramme ....................................... 27
IV.6. Détection des béta-lactamases inductibles : test d’antagonisme ....................................... 28
IV.7. Détection des béta-lactamases à spectre élargi (BLSE) : test de synergie ........................ 28
IV.8. Transfert génétique par conjugaison en milieu solide ...................................................... 28
IV.9. Recherche de gènes de résistance par PCR ....................................................................... 29
IV.10. Electrophorèse sur gel d’agarose .................................................................................... 30
IV.11. Extraction d’ADN plasmidique par lyse alcaline ........................................................... 30
RESULTATS ............................................................................................................................ 31
I. Paramètres physico-chimiques et microbiologiques ............................................................... 31
II.5.4.2. Classe B ........................................................................................................................ 16
II.5.4.3. Classe C ........................................................................................................................ 17
II.5.4.4. Classe D ........................................................................................................................ 17
III. Résistance aux antibiotiques dans l’environnement ............................................................. 18
MATERIEL ET METHODES ....................................................................................... 22
I. Présentation de la zone d’étude ........................................................................................ 22
II. Echantillonnage ................................................................................................................ 23
III. Matériel ................................................................................................................................ 23
III.1. Les antibiotiques en poudre ............................................................................................... 23
III.2. Les antibiotiques en disque ............................................................................................... 24
IV. Méthodes .............................................................................................................................. 25
IV.1. Analyse des paramètres physico-chimiques ..................................................................... 25
IV.1.1. Salinité ........................................................................................................................... 25
IV.1.2. Oxygène dissous ............................................................................................................ 25
IV.1.3. Potentiel hydrogène ........................................................................................................ 25
IV.1.4. La température ............................................................................................................... 25
IV.1.5. Demande biologique en oxygène (DBO 5 ) ..................................................................... 25
IV.1.6. Matières en suspension (MES) ................................................................................................. 26
IV.2. Analyse microbiologique par filtration sur membrane ..................................................... 26
IV.3. Prévalence de la résistance aux antibiotiques ................................................................... 26
IV.4. Isolement et identification bactérienne ............................................................................. 27
IV.5. Etude de la sensibilité aux antibiotiques par antibiogramme ....................................... 27
IV.6. Détection des béta-lactamases inductibles : test d’antagonisme ....................................... 28
IV.7. Détection des béta-lactamases à spectre élargi (BLSE) : test de synergie ........................ 28
IV.8. Transfert génétique par conjugaison en milieu solide ...................................................... 28
IV.9. Recherche de gènes de résistance par PCR ....................................................................... 29
IV.10. Electrophorèse sur gel d’agarose .................................................................................... 30
IV.11. Extraction d’ADN plasmidique par lyse alcaline ........................................................... 30
RESULTATS ............................................................................................................................ 31
I. Paramètres physico-chimiques et microbiologiques ............................................................... 31