I.3. RESISTANCE BACTERIENNE DANS L’ENVIRONNEMENT : ..................... 18
II. MATERIELS ET METHODES .............................................................................. 20
II.1. PRESENTATION DE LA ZONE D’ETUDE ...................................................... 20
II.2. METHODES ......................................................................................................... 22
II.2.1. Prélèvement ................................................................................................... 22
II.2.2. Etude paramétrique et microbiologique ......................................................... 22
II.2.2.1. Salinité .................................................................................................... 22
II.2.2.2. Oxygène dissous ..................................................................................... 22
II.2.2.3. Potentiel hydrogène (pH) ........................................................................ 22
II.2.2.4. La température ........................................................................................ 23
II.2.2.5 Demande biologique en oxygène (DBO 5 ) (Rodier et al., 1996) .............. 23
II.2.2.6. Matière en suspension (MES) ................................................................. 23
II.2.2.7. Analyse microbiologique par la méthode de filtration sur membrane
(Rodier et al., 1996) ......................................................................................................... 24
II.2.3. Prévalence de la résistance aux antibiotiques ................................................ 24
II.2.4. Caractérisation de la résistance aux antibiotiques (CTX ou IMP) ................. 25
II.2.4.1. Isolement et Identification bactérienne ................................................... 25
II.2.4.2. Diffusion en milieu gélosé : Antibiogramme ......................................... 26
II.2.4.3. Détection des β-lactamases inductibles : test d’antagonisme : ............. 27
II.2.4.4. Détection des β-lactamases à spetre élargi (BLSE) : test de synergie .... 28
II.2.4.5. Transfert génétique par conjugaison bactérienne ................................... 28
II.2.4.6. Recherche de gènes BLSE par PCR (Polymerase Chain Reaction) ....... 29
II.2.4.7. Electrophorèse sur gel d’agarose ............................................................ 31
III. RESULTATS ET DISCUSSIONS ......................................................................... 32
III.1. ETUDE PARAMETRIQUE ET MICROBIOLOGIQUE ................................... 32
III.2. PREVALENCE DE LA RESISTANCE AUX BETA-LACTAMINES ............. 34
II. MATERIELS ET METHODES .............................................................................. 20
II.1. PRESENTATION DE LA ZONE D’ETUDE ...................................................... 20
II.2. METHODES ......................................................................................................... 22
II.2.1. Prélèvement ................................................................................................... 22
II.2.2. Etude paramétrique et microbiologique ......................................................... 22
II.2.2.1. Salinité .................................................................................................... 22
II.2.2.2. Oxygène dissous ..................................................................................... 22
II.2.2.3. Potentiel hydrogène (pH) ........................................................................ 22
II.2.2.4. La température ........................................................................................ 23
II.2.2.5 Demande biologique en oxygène (DBO 5 ) (Rodier et al., 1996) .............. 23
II.2.2.6. Matière en suspension (MES) ................................................................. 23
II.2.2.7. Analyse microbiologique par la méthode de filtration sur membrane
(Rodier et al., 1996) ......................................................................................................... 24
II.2.3. Prévalence de la résistance aux antibiotiques ................................................ 24
II.2.4. Caractérisation de la résistance aux antibiotiques (CTX ou IMP) ................. 25
II.2.4.1. Isolement et Identification bactérienne ................................................... 25
II.2.4.2. Diffusion en milieu gélosé : Antibiogramme ......................................... 26
II.2.4.3. Détection des β-lactamases inductibles : test d’antagonisme : ............. 27
II.2.4.4. Détection des β-lactamases à spetre élargi (BLSE) : test de synergie .... 28
II.2.4.5. Transfert génétique par conjugaison bactérienne ................................... 28
II.2.4.6. Recherche de gènes BLSE par PCR (Polymerase Chain Reaction) ....... 29
II.2.4.7. Electrophorèse sur gel d’agarose ............................................................ 31
III. RESULTATS ET DISCUSSIONS ......................................................................... 32
III.1. ETUDE PARAMETRIQUE ET MICROBIOLOGIQUE ................................... 32
III.2. PREVALENCE DE LA RESISTANCE AUX BETA-LACTAMINES ............. 34