Chapitre I
Généralités
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nécessairement liées à la flore intestinale humaine ou animale et peuvent proliférer dans les sols ou dans
les milieux aquatiques (CEAEQ, 2005.a). Les coliformes comprennent les genres : Escherichia,
Citrobacter, Enterobacter, Klebsiella, Yersinia, Serratia.
b. Les Coliformes fécaux « thermotolérants » (CF)
Les coliformes fécaux, ou coliformes thermotolérants, sont un sous-groupe des coliformes totaux
capables de fermenter le lactose à une température de 44°C. L’espèce la plus fréquemment associée à ce
groupe bactérien est 'Escherichia coli et dans une moindre mesure, certaines espèces des genres
Citrobacter, Enterobacter et Klebsiella (CEAEQ, 2005.b).
La recherche des coliformes thermotolérants est très importante car un très grand nombre d’entre eux
vivent en abondance dans les matières fécales des animaux à sang chaud et de ce fait, constituent de très
bons indicateurs de pollution d’origine fécale. Leur densité est proportionnelle au degré de la pollution et
leur suivie dans l’environnement est également équivalente à celle des pathogènes (Rodier et al. 2005).
c. Les Streptocoques fécaux (SF)
L’expression « streptocoques fécaux » regroupe toutes les bactéries à Gram positif de forme cocci
sphériques légèrement ovales, catalase négative (PNUE/OMS, 1977).
Ils se disposent le plus souvent en diplocoques ou en chainettes (Leclerc et al., 1995). Ils peuvent se
multiplier dans des milieux présentant des pH allant jusqu’à 9,6. On peut par conséquent les utiliser
comme indicateurs d’organismes pathogènes qui ont une résistance similaire aux pH élevés (OMS, 1977).
Ils regroupent l'ensemble des streptocoques possédant la substance (acide teïchoique) antigénique
caractéristique du groupe D de la classification de Lancefield, tels que: Enterococcus faecalis, E.faecium,
E.durans, E.hirae, Streptococcus peals, S.buis et S. equines. Ces streptocoques du groupe D sont
généralement pris globalement en compte comme des témoins de pollution fécale, car tous ont un habitat
fécal (Rodier et al., 2005).
Les dénombrements des streptocoques fécaux présumés sont rarement effectués indépendamment des
dénombrements des coliformes.
Germes pathogènes
a. Les Salmonelles
De la famille des Entérobactereaceae, Gram négatif, aéro-anaérobies facultatifs, sous forme de bâtonnet.
Tous les produits d’origine animale sont susceptibles de contenir des salmonelles.ce sont des
microorganismes non sporulant, habituellement mobiles grâce à des flagelles péritriches ou immobiles,
mésophiles avec une température optimale de croissance de 37°C.Les salmonelles fermentent le glucose,
le maltose et le mannitol, avec production de gaz, mais elles ne fermentent pas le saccharose.elles
réduisent le sulfite en sulfure et décarboxylent la lysine(Bourgeois,1990).
Dans le milieu marin, les exutoires d’eaux usées constituent la principale source de pollution par les
salmonelles (Leclerc et al, 1995).
b. Les Vibrions
Les vibrions appartiennent à la famille des Vibrionaceae, elle comprend des bacilles à Gram négatif qui
sont soit mobiles par une ciliature polaire, péritriche, ou bien immobiles. Ils sont oxydases positives,
réduisent les nitrates et dégradent des glucides par métabolisme fermentatif. Au sein de cette famille, on
distingue 4 genres : Vibrio, Aeromonas, Plesiomonas et Photobacterium.
Les bactéries du genre Vibrio sont des bacilles incurvés ou droits, mobiles grâce à un flagelle polaire,
basophiles, oxydase positive, ils présentent une importance particulière dans la contamination des eaux et
des fruits de mer. La plupart des vibrions sont d’origine marine, ils ne se multiplient qu’en présence de
NaCl. On distingue une trentaine d’espèces différentes, les plus importantes qui sont réputées pathogènes
pour l’homme sont : V. parahaemolyticus, V. cholerae et V. vulnificus (Singleton et Sainsbury, 1984).
Généralités
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nécessairement liées à la flore intestinale humaine ou animale et peuvent proliférer dans les sols ou dans
les milieux aquatiques (CEAEQ, 2005.a). Les coliformes comprennent les genres : Escherichia,
Citrobacter, Enterobacter, Klebsiella, Yersinia, Serratia.
b. Les Coliformes fécaux « thermotolérants » (CF)
Les coliformes fécaux, ou coliformes thermotolérants, sont un sous-groupe des coliformes totaux
capables de fermenter le lactose à une température de 44°C. L’espèce la plus fréquemment associée à ce
groupe bactérien est 'Escherichia coli et dans une moindre mesure, certaines espèces des genres
Citrobacter, Enterobacter et Klebsiella (CEAEQ, 2005.b).
La recherche des coliformes thermotolérants est très importante car un très grand nombre d’entre eux
vivent en abondance dans les matières fécales des animaux à sang chaud et de ce fait, constituent de très
bons indicateurs de pollution d’origine fécale. Leur densité est proportionnelle au degré de la pollution et
leur suivie dans l’environnement est également équivalente à celle des pathogènes (Rodier et al. 2005).
c. Les Streptocoques fécaux (SF)
L’expression « streptocoques fécaux » regroupe toutes les bactéries à Gram positif de forme cocci
sphériques légèrement ovales, catalase négative (PNUE/OMS, 1977).
Ils se disposent le plus souvent en diplocoques ou en chainettes (Leclerc et al., 1995). Ils peuvent se
multiplier dans des milieux présentant des pH allant jusqu’à 9,6. On peut par conséquent les utiliser
comme indicateurs d’organismes pathogènes qui ont une résistance similaire aux pH élevés (OMS, 1977).
Ils regroupent l'ensemble des streptocoques possédant la substance (acide teïchoique) antigénique
caractéristique du groupe D de la classification de Lancefield, tels que: Enterococcus faecalis, E.faecium,
E.durans, E.hirae, Streptococcus peals, S.buis et S. equines. Ces streptocoques du groupe D sont
généralement pris globalement en compte comme des témoins de pollution fécale, car tous ont un habitat
fécal (Rodier et al., 2005).
Les dénombrements des streptocoques fécaux présumés sont rarement effectués indépendamment des
dénombrements des coliformes.
Germes pathogènes
a. Les Salmonelles
De la famille des Entérobactereaceae, Gram négatif, aéro-anaérobies facultatifs, sous forme de bâtonnet.
Tous les produits d’origine animale sont susceptibles de contenir des salmonelles.ce sont des
microorganismes non sporulant, habituellement mobiles grâce à des flagelles péritriches ou immobiles,
mésophiles avec une température optimale de croissance de 37°C.Les salmonelles fermentent le glucose,
le maltose et le mannitol, avec production de gaz, mais elles ne fermentent pas le saccharose.elles
réduisent le sulfite en sulfure et décarboxylent la lysine(Bourgeois,1990).
Dans le milieu marin, les exutoires d’eaux usées constituent la principale source de pollution par les
salmonelles (Leclerc et al, 1995).
b. Les Vibrions
Les vibrions appartiennent à la famille des Vibrionaceae, elle comprend des bacilles à Gram négatif qui
sont soit mobiles par une ciliature polaire, péritriche, ou bien immobiles. Ils sont oxydases positives,
réduisent les nitrates et dégradent des glucides par métabolisme fermentatif. Au sein de cette famille, on
distingue 4 genres : Vibrio, Aeromonas, Plesiomonas et Photobacterium.
Les bactéries du genre Vibrio sont des bacilles incurvés ou droits, mobiles grâce à un flagelle polaire,
basophiles, oxydase positive, ils présentent une importance particulière dans la contamination des eaux et
des fruits de mer. La plupart des vibrions sont d’origine marine, ils ne se multiplient qu’en présence de
NaCl. On distingue une trentaine d’espèces différentes, les plus importantes qui sont réputées pathogènes
pour l’homme sont : V. parahaemolyticus, V. cholerae et V. vulnificus (Singleton et Sainsbury, 1984).