RESULTATS
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III. RESULTATS
Dans ce travail nous nous sommes intéressés aux bactéries résistantes au Ciprofloxacine
(CIP), un antibiotique puissant et un indicateur de la production de mécanisme de
résistance acquis. Vingt huit souches lactose positif et résistantes au Ciprofloxacine
récupérées lors d’une étude réalisée en 2010 (Berkane et Zian, 2010) ont fait l’objet de la
détermination de leurs groupes phylogénétiques ainsi que l’association de ce fond
génétique avec la résistance aux antibiotiques.
III.1. Identification Bactérienne
Les résultats de l’identification biochimique par galeries API20E des 28 souches isolées,
ont révélé que toutes les souches sont des E.coli dont 16 collectées à partir des eaux usées
et 12 à partir des eaux usées traitées.
III.2. Phylogénie des souches d’E. coli résistantes aux quinolones.
A fin de déterminer la phylogénie des 28 souches d’E.coli résistantes aux quinolones nous
nous sommes intéressés à la recherche des gènes (chu A, Yja) et le fragment d’ADN
TSPE4.C2 qui nous permet de grouper ces souches en 4 groupes : A, B 1 , B 2 et D. Ce travail
a pour objectif la détermination des groupes phylogénétiques avant et après traitement ainsi
que leur association avec la multirésistance des souches.
III.2.1. Recherche du gène chuA
Les résultats de la PCR révèle que le marqueur chuA été présent dans une seule souche
isolée à partir des eaux usées et trois souches isolées à partir des eaux traitées (Figure 11,
tableau 3). La présence de ce gène indique que les ces souches font partie du groupe
(D+B2), alors que toutes les autres souches restantes seraient de type commensal (A+B1).
III.2.2. Recherche du gène YjaA
De la même manière, le marqueur yjaA a été trouvé chez 15 souches d’E. coli dont 2
possédant déjà le gène ChuA ce qui nous permet de les classer dans le groupe B2. Les deux
autres souches ChuA+ et YjaA- sont assignées au groupe D (Figure 12, Tableau 3).
Il est à signale que la présence de ce gène chez les souches ChuA- n’est pas prise en
considération dans la classification de Clermont et al., (2000).
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III. RESULTATS
Dans ce travail nous nous sommes intéressés aux bactéries résistantes au Ciprofloxacine
(CIP), un antibiotique puissant et un indicateur de la production de mécanisme de
résistance acquis. Vingt huit souches lactose positif et résistantes au Ciprofloxacine
récupérées lors d’une étude réalisée en 2010 (Berkane et Zian, 2010) ont fait l’objet de la
détermination de leurs groupes phylogénétiques ainsi que l’association de ce fond
génétique avec la résistance aux antibiotiques.
III.1. Identification Bactérienne
Les résultats de l’identification biochimique par galeries API20E des 28 souches isolées,
ont révélé que toutes les souches sont des E.coli dont 16 collectées à partir des eaux usées
et 12 à partir des eaux usées traitées.
III.2. Phylogénie des souches d’E. coli résistantes aux quinolones.
A fin de déterminer la phylogénie des 28 souches d’E.coli résistantes aux quinolones nous
nous sommes intéressés à la recherche des gènes (chu A, Yja) et le fragment d’ADN
TSPE4.C2 qui nous permet de grouper ces souches en 4 groupes : A, B 1 , B 2 et D. Ce travail
a pour objectif la détermination des groupes phylogénétiques avant et après traitement ainsi
que leur association avec la multirésistance des souches.
III.2.1. Recherche du gène chuA
Les résultats de la PCR révèle que le marqueur chuA été présent dans une seule souche
isolée à partir des eaux usées et trois souches isolées à partir des eaux traitées (Figure 11,
tableau 3). La présence de ce gène indique que les ces souches font partie du groupe
(D+B2), alors que toutes les autres souches restantes seraient de type commensal (A+B1).
III.2.2. Recherche du gène YjaA
De la même manière, le marqueur yjaA a été trouvé chez 15 souches d’E. coli dont 2
possédant déjà le gène ChuA ce qui nous permet de les classer dans le groupe B2. Les deux
autres souches ChuA+ et YjaA- sont assignées au groupe D (Figure 12, Tableau 3).
Il est à signale que la présence de ce gène chez les souches ChuA- n’est pas prise en
considération dans la classification de Clermont et al., (2000).