Chapitre I : Généralités
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ensemble d’indices de fixation (F) qui permettent demesurer et d’estimer la fixation des
allèles dans les populations. L’indice F mesure la perted’hétérozygotes par rapport à la
panmixie totale dans une population. Il représente aussi lecoefficient de corrélation entre les
allèles se rencontrant pour former un zygote. Dans lespopulations, trois niveaux hiérarchiques
peuvent être observés: celui de l’individu (I), celui des sous-populations à laquelle il
appartient (S) et enfin celui de la population considérée dansson ensemble (T). Par
conséquent, trois indices de fixation ont été définis (Wright, 1969): Fis,relatif à l’individu et
aux sous-populations, Fit, relatif à l’individu et à la population totale etenfin Fst, relatif à la
sous population et à la population totale. Ces trois indices sont liés par larelation suivante:
(1-Fit) = (1-Fis) (1-Fst).
Fis = HS - HI/HS est le déficit du à des causes internes aux sous populations.
HIreprésente l’hétérozygotie moyenne de l’individu sur l’ensemble des sous populations,
HScorrespond à l’hétérozygotie attendue dans une sous population (HS est la moyenne des
HSsur les K sous populations). Si les sous populations sont à l’équilibre de Hardy-Weinberg,
Fissera égal à 0. Si le Fis est négatif, les sous populations présentent, au contraire, un
excèsd’hétérozygotes. Si Fis est positif, ceci indique un déficit en hétérozygotes.
Fit = HT - HI/HT traduit la réduction de l’hétérozygotie globale entre les individus et
lapopulation globale théorique. HT est l’hétérozygotie attendue si toutes les souspopulationsétaient regroupées en une seule unité panmictique.
Fst = HT - HS/HT mesure la réduction de l’hétérozygotie des individus à l’intérieur de leur
sous-population. Entre les sous-populations et la population totale, l’effet de la subdivision est
exprimé par l’indice Fst qui est lié aux différences de fréquences alléliques moyennes entre
les sous populations, induites par l’effet de la dérive génétique.
Ce paramètre mesure la différenciation génétique entre les populations locales. Dans le cas
où toutes lessous-populations sont en équilibre et ont la même fréquence allélique, Fst est nul.
Dans le casoù les sous populations sont à l’équilibre de Hardy Weinberg, Fis = 0 et donc Fst =
Fit. Si, enplus, les fréquences alléliques sont égales, Fis = Fit = Fst = 0.
3.3 Notion espèces :
On définit une espèce comme un ensemble d’individus capables de se reproduire entre
eux et de donner naissance à une descendance elle-même fertile (Chikhi, 1995).
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ensemble d’indices de fixation (F) qui permettent demesurer et d’estimer la fixation des
allèles dans les populations. L’indice F mesure la perted’hétérozygotes par rapport à la
panmixie totale dans une population. Il représente aussi lecoefficient de corrélation entre les
allèles se rencontrant pour former un zygote. Dans lespopulations, trois niveaux hiérarchiques
peuvent être observés: celui de l’individu (I), celui des sous-populations à laquelle il
appartient (S) et enfin celui de la population considérée dansson ensemble (T). Par
conséquent, trois indices de fixation ont été définis (Wright, 1969): Fis,relatif à l’individu et
aux sous-populations, Fit, relatif à l’individu et à la population totale etenfin Fst, relatif à la
sous population et à la population totale. Ces trois indices sont liés par larelation suivante:
(1-Fit) = (1-Fis) (1-Fst).
Fis = HS - HI/HS est le déficit du à des causes internes aux sous populations.
HIreprésente l’hétérozygotie moyenne de l’individu sur l’ensemble des sous populations,
HScorrespond à l’hétérozygotie attendue dans une sous population (HS est la moyenne des
HSsur les K sous populations). Si les sous populations sont à l’équilibre de Hardy-Weinberg,
Fissera égal à 0. Si le Fis est négatif, les sous populations présentent, au contraire, un
excèsd’hétérozygotes. Si Fis est positif, ceci indique un déficit en hétérozygotes.
Fit = HT - HI/HT traduit la réduction de l’hétérozygotie globale entre les individus et
lapopulation globale théorique. HT est l’hétérozygotie attendue si toutes les souspopulationsétaient regroupées en une seule unité panmictique.
Fst = HT - HS/HT mesure la réduction de l’hétérozygotie des individus à l’intérieur de leur
sous-population. Entre les sous-populations et la population totale, l’effet de la subdivision est
exprimé par l’indice Fst qui est lié aux différences de fréquences alléliques moyennes entre
les sous populations, induites par l’effet de la dérive génétique.
Ce paramètre mesure la différenciation génétique entre les populations locales. Dans le cas
où toutes lessous-populations sont en équilibre et ont la même fréquence allélique, Fst est nul.
Dans le casoù les sous populations sont à l’équilibre de Hardy Weinberg, Fis = 0 et donc Fst =
Fit. Si, enplus, les fréquences alléliques sont égales, Fis = Fit = Fst = 0.
3.3 Notion espèces :
On définit une espèce comme un ensemble d’individus capables de se reproduire entre
eux et de donner naissance à une descendance elle-même fertile (Chikhi, 1995).